我校于1993年开始筹办中西医结合临床医学专业，并于当年招生，1994年经湖南省教委批准设置中西医结合临床医学专业，1998年正式成立中西医结合系，并于2000年增设中西医临床医学七年制本硕连读专业。2003年经教育部批准，我校将该专业正式定名为“中西医临床医学专业”，并成立了中西医结合学院，中西医结合学院下设办公室1个，教研室5个，学生办公室1个，主要承担了中西医结合、应用心理学两门学科的教学和科研任务，以及中西医结合五、七年制和应用心理学四年制的管理工作。现有本专业教师83人，其中高级专业技术人员60名，中级专业技术人员21名。博士23名，硕士48名。本专业为全国中西医结合学会教育工作委员会主任委员单位，中西医结合临床医学学科具有博士、硕士、学士三级学位授予权，中西医结合基础学科具有硕士学位授予权。现有博士生导师（包括兼职）10人，硕士生导师（包括兼职）72人。2007年中西医结合学科批准为博士后科研流动站。中西医结合临床学科为省级重点建设学科，中西医结合基础及临床专业已成为研究生、本科生招生的热门专业。

 现在校本科（含五年制、七年制）、研究生（含硕士生、博士生）近2000余人，形成了多层次、较大规模、颇具影响的中西医结合人才培养基地。在人才培养的同时，加大力度进行学科的建设，2002年完成中西医结合临床基础科研实验室（蛋白质组学实验室）建设，并通过国家中医药管理局二级中医药科研实验室验收；2003年与学院病理生理实验室、血管生物学实验室重组为“中医病证实验室”，确定为湖南省教育厅重点实验室。1998年以来，引进一批高层次科研、教学人才，承担了国家、省、厅各级中西医结合科研、教研课题100多项，经费648万元；获得各级科研、教研成果奖30多项，其中省部以上科研、教研成果奖20项；主持出版了专着、教材、教参60多部；发表学术论文400多篇，形成了较稳定且在全国居于先进甚或领先的水平学科研究方向，具备较大学术影响的学科带头人和学术带头人，以及结构合理的中青年骨干队伍，在中西医结合临床本科教育体系的研究和实践、中西医结合防治心脑血管、肿瘤、生殖系疾病、神经系统疾病及头颈部恶性肿瘤等方面，取得了较大成就，在国内外形成了较大的影响，为中西医结合学科体系的建立与完善，中西医结合人才的培养，中医药科研产业化等，均做出了较大贡献。